Mitochondrial and plastid genomes of the monoraphid diatom Schizostauron trachyderma

CC BY Logo DOI

We provide for the first time the complete plastid and mitochondrial genomes of a monoraphid diatom: Schizostauron trachyderma. The mitogenome is 41,957 bp in size and displays two group II introns in the cox1 gene. The 187,029 bp plastid genome features the typical quadripartite architecture of diatom genomes. It contains a group II intron in the petB gene that overlaps the large single-copy and the inverted repeat region. There is also a group IB4 intron encoding a putative LAGLIDADG homing endonuclease in the rnl gene. The multigene phylogenies conducted provide more evidence of the proximity between S. trachyderma and fistula-bearing species of biraphid diatoms.

Tytuł
Mitochondrial and plastid genomes of the monoraphid diatom Schizostauron trachyderma
Twórca
Górecka Ewa
Słowa kluczowe
Monoraphid; biraphid; diatoms; organellar; genome; multigene; phylogeny; LAGLIDADG; jednorafowe; dwurafowe; okrzemki; genom organelli; filogeneza wielogenowa
Współtwórca
Gastineau Romain ORCID 0000-0001-8661-5118
Davidovich Nikolai A
Davidovich Olga I
Ashworth Matt P
Sabir Jamal S M
Lemieux Claude
Turmel Monique
Witkowski Andrzej ORCID 0000-0003-1714-218X
Data
2021
Typ zasobu
artykuł
Identyfikator zasobu
DOI 10.3390/ijms222011139
Źródło
International Journal of Molecular Sciences, 2021, vol. 22 iss. 20, [br. s.], 11139
Język
angielski
Prawa autorskie
CC BY CC BY
Kategorie
Publikacje pracowników US
Data udostępnienia25 lis 2021, 14:24:06
Data mod.1 mar 2022, 11:53:05
DostępPubliczny
Aktywnych wyświetleń0